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現代科學技術，如功能性磁共振成像儀和腦電圖，已被用來觀察，當人們打坐時以及當人們規律打坐後，他們的身體和大腦怎麼變化。

這些研究已經顯示，定期冥想操練的結果，造成身體明顯的變化。例如，理察•戴維森和茲恩-津恩的一項研究顯示，八週正念為基礎的冥想訓練顯著地增進左側前大腦活動，這個活動與正向的情緒狀態有關。正向情緒可以是一個技能，可以像學習騎自行車或彈鋼琴那樣的訓練來做到。

自從1950年代以來，數以百計的冥想研究已經進行，但許多早期的研究是有缺陷的，因而產生不可靠的結果。更多最近的評論已經指出，許多這些缺陷是希望引導當前的研究，到一個更富有成效的路徑上。更多的報告評估，進一步的研究需要導向對冥想的理論建構及對冥想的定義。

人們自古已在宗教傳統中操練冥想，特別是在寺院中。現在在西方也有許多非宗教性的冥想課程存在，包括正念為基礎的課程。今天，正念為基礎的冥想課程已經在西方醫學和心理學界內流行，這主要是由於這樣的過程對患有壓力相關健康狀況的患者，有觀察得到的正面影響。

西方心理學中的冥想

放鬆反應

赫伯特本森博士-身心醫學研究所(Mind-Body Medical Institute)的創辦人，這個研究所是隸屬於哈佛大學和波士頓幾個醫院。他報告說，冥想能引起一系列統稱為「放鬆反應」的體內生化和物理變化。這放鬆反應包括代謝變化，心臟跳動率，呼吸，血壓和大腦化學物質的變化。本森博士和他的團隊也在喜馬拉雅山脈的佛教寺院做臨床研究。本森寫了《放鬆反應》這本書記錄冥想的好處，這在1975年時尚未廣為人知。

冥想的平靜效果

根據在「心理學報」2006年3月的一篇文章，做冥想活動會讓腦電圖相關的活動放緩。人類的神經系統是由副交感神經系統和交感神經系統組成，前者調控心臟速率、呼吸和其他不自主運動功能。後者則是要喚起身體對劇烈活動作準備。美國國家衛生研究院（NIH）有寫下以下敘述：「目前有被認為，某些類型的冥想可能有效，這是由於冥想減少交感神經系統活動及增加副交感神經系統的活動「，或者也可以說，冥想造成激發活動的減低以及增加了放鬆。

西方的治療用途和MBSR

做為減輕壓力和疼痛的一個方法，冥想已經進入醫療保健的主流。做為減輕壓力的一個方法，冥想已經被應用於醫院中的慢性或絕症個案，以減低因升高的壓力-包含已被壓抑的免疫系統-的複雜性。在醫學界，有越來越多人同意，心理因素，如壓力、緊張的確是身體缺乏健康的部分因素，在主流科學裡，有越來越多人對這個領域的研究提供資助。

2003年一項對MBSR課程-MBSR中的操練，包含對意識的不斷覺知而且不尋求壓抑念頭-的元分析(meta-analysis)統計研究得出一個結論:冥想可能對一個企圖處理臨床和非臨床問題的人是有用的。對幾種病的診斷，包括慢性疼痛，纖維肌痛，癌症患者和冠狀動脈疾病發現，MBSR是有幫助的。改善包含了身體和心理層面。

流

正念冥想、安般念以及相關的技術，旨在為了引發洞察力而培養注意力，。一個更廣泛，更靈活的注意力可以更容易地了知情境，更容易在情感或道德上的困境中保持客觀，而且更容易達到的一個反應性的、創造性的覺知或心流（流暢，flow）的狀態。哈佛大學醫學院的研究也顯示，冥想過程中，實驗中的生理訊號顯示呼吸減緩，還有心臟跳動率和血含氧飽和度上升。

對不同冥想方式的研究

內觀禪修

由耶魯大學，哈佛大學，麻薩諸塞州總醫院所做的一項研究顯示，冥想在大腦的特定區域增加灰腦質，並可能減緩自然老化過程中的大腦退化這一部分。

該實驗有20個人進行密集的佛教「內觀冥想」訓練，另15人則沒有打坐。腦部掃描顯示，那些打坐的人在腦部負責注意力和處理感覺輸入訊息部位的灰質厚度有增加。一些參與者每天打坐40分鐘，而其他人已經打坐多年。實驗結果顯示，腦厚度的變化依時間的冥想時間的長短變化。厚度的增加在0.004和0.008英寸（0.1016毫米- 0.2032毫米）之間。

Zazen

詹姆斯•奧斯汀博士-在美國科羅拉多大學的神經生理學家-在他的書禪與腦(Zen and the Brain)（奧斯汀，1999）中報告說，操練冥想禪 會「重組大腦中的電路」。透過使用功能性磁共振成像儀,測量大腦中血液流動的掃描技術，這已被確認。need citation