目前發現益生元的主要作用對象是雙歧杆菌和乳酸杆菌這兩種重要的有益菌，益生元促進腸道菌群健康也是研究比較透徹的兩種微生物，但隨著研究的深入及涉及范圍的擴大，越來越多的其它種類有益菌也逐漸被納入益生元的作用對象范疇。
眾所周知，益生元是一種不能被人體消化吸收，但到達大腸後能被腸道微生物完全水解的物質。水解後產生的代謝產物可以對人體產生許多有益的作用，如短鏈脂肪酸(SCFA)，它不僅是腸上皮細胞的主要能量來源，還與其他健康益處有關，包括抗炎作用和飲食調節誘導的肥胖。腸道微生物還產生其他生物活性物質，包括維生素和礦物質，並通過競爭性排斥減少病原體的定植。
一項學習英美國家科學家的聯合進行研究可以發現，老年社會人在長期服用過程中凝結形成芽孢杆菌GBI-30、6086 (GanedenBC30(BC30))，並配合益生元低聚半乳糖(GOS)和低聚果糖(FOS)，
糞細菌prausnitzii、lituseburense梭菌和真細菌均顯著升高，短鏈脂肪酸濃度也顯著升高。相關研究發表在《厭氧菌》雜志上。
一項為期28天的隨機、雙盲、對照試驗在體重指數為18-31公斤/平方米的65-80歲健康成年人中進行。試驗期間，試驗組接受凝結芽孢杆菌 bc30膠囊，每日含1 × 107個菌落形成單位，而對照組接受安慰劑(顯微晶質纖維素)。幹預後，取6名志願者(bc30組3人，安慰劑組3人)的糞便樣本，接種於厭氧培養槽中。在發酵罐中加入純度為48% 或95% 的 fos，對照組分別在無益生素的基礎培養基上飼喂0、12和24小時。
如表1和圖1-3所示。Goss和FOS對菌群的影響呈正相關，包括乳杆菌(P \\u003C 0.001，P \\u003C 0.0001)、雙歧杆菌(均P \\u003C 0.0001)、直腸真細菌(p=0.009，p= 0.002)和普氏梭菌(p=0.0002，p=0.001)此外，雙歧杆菌數量的增加具有重要意義，因為它是一個已知的正在減少的屬
另外，擬杆菌屬(p = 0.012)和斜紋夜蛾(c. litus borense)也有較大的差異。(p = 0.012).這兩種細菌在生長底物為碳水化合物(益生元)的前提下，能產生大量有益的丁酸、乙酸和丙酸。雖然一些細菌只對其中一種益生元有顯著反應，但兩種試驗材料之間沒有發現顯著差異。治療組與益生元組、非益生元組比較，差異有統計學意義(p < 0.05)。圖1 ~ 3。
如圖3所示，在服用益生元後，相比較可以使用進行安慰劑的試驗研究對象，使用BC30的人群以及芽孢杆菌細胞數量非常明顯顯著高於企業使用時間安慰劑的人群，與服用安慰劑治療的人認為相比，C. litsueburense和F.prausnitzii亦同。說明益生元搭配BC30有一個具有明顯的增效促進作用。
對SCFA的影響
有機酸產量的變化見表2。在發酵罐中添加碳水化合物，有機酸濃度差異顯著，益生元和 fos 的有機酸濃度差異顯著。丙酸濃度(p = 0.0006)、丙戊酸濃度(p = 0.0017)和甲酸濃度(p = 0.04)也有顯著性差異。其他有機酸含量隨時間增加而增加，但各處理間差異不顯著。Bc30組三種主要脂肪酸(醋酸鹽、丙酸鹽和丁酸鹽)的總體濃度比安慰劑組增加更多。
微生物群的組成變化會影響宿主的健康，在微生物群因疾病或抗生素治療而不穩定後，常建議使用益生菌和益生元幹預。益生菌和益生元對人體腸道菌群的有益作用和特定腸道菌群的增加所帶來的有利影響已為人所知。
然而，使用孢子形成益生菌增加了對寄主的潛在好處，特別是當與益生元的積極好處就是結合生活在一起時。這是我們因為孢子比營養細胞有更好的生存分析能力。攝入凝結芽孢杆菌BC30能夠得到顯著水平增加學生已知的微生物群數量，從而導致引發學習一些社會有益的影響。組間Bacillus spp.差異也可能會因此產生具有積極的影響，因為如果它們之間通過數據生成維生素、礦物質和有機酸來產生對腸道健康教育有益的代謝物，這些企業物質文化可以不斷改變教學環境，創造不利於病原體定殖的條件。
綜上所述，補充益生元後有益菌菌群數量增加。攝入BC30的人的糞便微生物群顯示出E.rectale、F. prausnitzii和C. lituseburense的數量增加，這些被認為對有機酸的濃度有顯著影響。志願者服用益生菌BC30 28天後，糞便菌群中添加益生元後，醋酸鹽、丙酸鹽和丁酸鹽的濃度也有所增加。顯示益生菌群的增加和隨後的益生元補充，可能為改善老年人和那些處於腸道微生物群有利活動減少狀態的人的腸道健康提供另一條途徑。
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