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財政部南區國稅局屏東分局表示，自104年度起，非屬小規模之獨資、合夥組織營利事業辦理結算、決算及清算申報時，應以其全年應納稅額之半數，減除尚未抵繳之扣繳稅額，計算其應納之結算稅額，於申報前自行繳納；並以其營利事業所得額減除全年應納稅額半數後之餘額，列為獨資資本主或合夥人個人綜合所得稅之營利所得，課徵綜合所得稅，但小規模之營利事業，仍維持現行課稅制度，無須辦理結（決）、清算申報，其營利事業所得額，由獨資資本主或合夥人列為個人綜合所得稅的營利所得，課徵綜合所得稅。

舉例來說，甲商號104年度全年營利事業所得額為100萬元，利息收入扣繳稅額1萬元，甲商號於105年5月申報營利事業所得稅時，須自行繳納營利事業所得稅7.5萬元（課稅所得100萬元x營利事業所得稅率17%x1/2－扣繳稅額1萬元）。
該分局提醒，獨資合夥事業報繳營利事業所得稅的新規定在104年度施行，於105年5月申報時適用，但獨資合夥事業若於104年度中結束營業，仍應依新規定辦理決、清算之報繳。