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臺南市動保處於1月14日起連夜啟動防疫撲殺作業，至15日止撲殺7場確診為H5禽流感核酸病毒陽性場，賴市長慰勉及肯定市府同仁辛勞及努力，對於此次疫情不可小覷，為避免疫情擴散蔓延，本市防疫遵照中央高規格的處置方式，採取周密及嚴格謹慎的標準，不容有任何疏忽，為養禽產業持續把關及永續經營盡一份心力。

鑒於本市防疫人力上的不足，賴市長北上建請國防部進行支援協助，獲得行政院長及國防部長同意共同為防疫出人出力，讓本市未來執行防疫工作不至於出現問題。

動保處李處長感謝市長及中央部會長官之兵力支援，於16日上午至麻豆區公所與臺南市後備指揮部出動的國軍人力表達致謝，並表示獸醫師本著專業天職，必定為此次禽流感疫情防疫不懈怠，但因人力及體力有限，仍須有外界支援來協助，使禽流感撲殺作業等工作更迅速完善完成。

動保處也表示檢出H5禽流感陽性的白肉雞場，雖未分型及確認高低病原性，但因雞隻死亡率暴增，為控制疫情並配合防檢局撲殺政策，動保處採取高規格必要性之預防性撲殺作業，對於該場撲殺賠償費用將由中央予以補助。

本市疑似禽流感疫情至16日上午8時止已送檢23場疑似禽流感檢體，分別為鵝場17場、鴨場5場、白肉雞1場，目前H5禽流感核酸病毒陽性有12場，確診場將於16日完成撲殺清場作業，動保處表示防疫共同一體，仍會持續監控疫情，並請養禽業者加強生物安全防疫消毒工作，希望盡快渡過此波禽流感疫情威脅。