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幽門桿菌感染途徑為經口傳染。經口傳染可能之來源為接觸到人之胃逆流物或接觸到經糞便污染之食物或水。甚至可能經由口腔與口腔接觸而傳染，與個人的生活習慣和衛生環境也有很大關連。根據衛生署疾病管制局資料顯示台灣地區幽門桿菌感染率為54.4%，而且感染率會隨著年齡上升而增加。

早期研究顯示幽門桿菌與十二指腸潰瘍的相關性最高，為80~95%，但近5年內研究發現幽門桿菌與十二指腸潰瘍的相關性下降至77%，主要可能為服用非類固醇類消炎止痛藥所導致的消化性潰瘍病人增加。

另外，長期服用非類固醇類消炎止痛藥同時合併有幽門桿菌所致潰瘍出血機率比沒有服用非類固醇類消炎止痛藥或沒有幽門桿菌感染之潰瘍增加61倍。其他報告顯示幽門桿菌與胃潰瘍相關性為65~95%，與消化不良相關性為20~60%，與胃癌相關性為30~40%，而無症狀病人為20~45%。

幽門桿菌檢測分為侵入性檢查與非侵入性檢查。侵入性檢查為做胃鏡時直接取胃組織化驗有無幽門桿菌或者做病理組織學鏡檢或細菌培養。非侵入性檢查有碳13呼氣測驗、糞便抗原檢查或抽血檢查。

目前幽門桿菌除菌治療第一線藥物為質子幫浦阻斷劑加上兩種抗生素的三合療法治療7~14天，治癒率近80%。副作用可能會出現腸胃不適或者口腔有金屬味覺。結束幽門桿菌除菌治療後的4~6週後應追蹤確定是否已經根除。一般會建議抗生素停用至少4週後和質子幫浦阻斷劑停用至少2週後再做幽門桿菌檢查避免有偽陰性發生。

根據美國腸胃科醫學會建議，並不是所有人都應該檢測有無幽門桿菌感染。建議檢查的人為：

(1)   如果檢查結果為陽性，有計畫要治療者。

(2)   有胃黏膜相關淋巴組織淋巴瘤、消化性潰瘍或有消化性潰瘍的過去病史者。

(3)   年齡小於55歲有上消化道不適，但無一些應警覺的症狀如吞嚥疼痛或吞嚥困難、易有飽足感、無原因之體重減輕、出血、貧血、反覆嘔吐、有腸胃道腫瘤家族病史或個人之前有胃食道腫瘤的病史，可以檢測並治療 (“test and treat”)者。

行政院衛生署中央健保局藥品給付針對幽門桿菌根除治療102年版規定：

‧消化性潰瘍病人得進行初次幽門螺旋桿菌消除治療，使用時需檢附上消化道內視鏡檢查或上消化道Ｘ光攝影報告並註明初次治療。

‧幽門螺旋桿菌之消除治療療程以二週為原則，特殊病例需延長治療或再次治療，需檢附相關檢驗報告說明理由。

‧下列病人若因長期服用非類固醇類消炎止痛藥而需使用前列腺素劑(如misoprostol)，得免附胃鏡報告：

Ⅰ.紅斑性狼瘡。

Ⅱ.五十歲以上罹患類風濕性關節炎或僵直性脊椎炎之病人。

目前並不建議所有幽門桿菌檢查呈現陽性之健康並且無消化道不適的民眾都要做幽門桿菌根除治療。畢竟不是所有幽門桿菌感染都會致病，只有少數幽門桿菌感染會致癌而且全球的幽門桿菌感染盛行率都差不多，但胃癌的發生率有地區性的不同。

奇美醫學中心一般內科主治醫師郭妍伶表示：幽門桿菌感染後的致病機轉相當複雜，與基因環境和細菌本身都有相關，可解釋幽門桿菌感染後所導致的不同狀況，所以應該由醫師判斷哪些人需要檢測幽門桿菌感染和治療。