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依統一發票使用辦法第7條及第9條規定，營業人銷售貨物或勞務與營業人時，應開立三聯式統一發票，並載明買受人名稱及統一編號。如開立二聯式統一發票，因未載明買受人統一編號，會涉及開立統一發票應行記載事項却未依規定記載之違章行為，依加值型及非加值型營業稅法（下稱營業稅法）第48條規定，應按統一發票所載銷售額處1%罰鍰，其金額最少1,500元，最高可罰15,000元。

南區國稅局最近查獲甲公司銷售貨物給乙商號，未開立三聯式統一發票而開立二聯式統一發票，甲公司主張乙商號因屬小規模營業人，無申報進貨發票抵稅之需求，只要求開立二聯式發票作為雙方交易憑證，其已誠實申報銷售額，並無逃漏稅，不應處罰。但依上述稅法規定，營業人與其他營業人交易時，應開立三聯式發票並載明買受人名稱及統一編號，如果誤開成二聯式統一發票，因發票上面缺少買受人統一編號，該應行記載事項未依規定記載，雖未造成逃漏稅，仍應處行為罰。
該局指出，小規模營業人雖非屬加值體系營業人，免用統一發票，但為鼓勵其索取統一發票以掌握稅源，營業稅法第25條規定，小規模營業人購買營業上使用之貨物或勞務，取得載有營業稅額之憑證，並依規定申報者，主管稽徵機關應按其進項稅額10%，在查定稅額內扣減。因此，小規模營業人取得進項憑證，符合相關規定者，仍有抵稅權利，籲請使用統一發票營業人注意，銷售對象如屬小規模營業人，應依規定開立三聯式發票，並載明買受人名稱及統一編號，以免受罰。