第七大願。願我來世。得菩提時。若諸有情。眾病逼切。無救無歸。無醫無藥。無親無家。貧窮多苦。我之名號。一經其耳。眾病悉除。身心安樂。家屬資具。悉皆豐足。乃至證得無上菩提。
「除病安樂願」
人的可貴就在於有人身，可以好好修行。
人的可嘆也在於有人身，百穢集聚，苦不堪言，道心難持。身心安樂是求道的極大助緣，所以修行的第一樁事就是保持健康，才能圓滿一切事業。如何維持健康？就是──「明白因果」：
喜歡運動，則身強體健；熬夜作樂，則臟腑俱損。
飲食清淡，身體負擔少；魚肉葷膩，消化大不易。
最好是「學佛」。
行住坐臥皆有節制，身體自然健康。
安住當下少欲少求，心情自在爽朗。
此即藥師大願的真實慈悲！
第八大願。願我來世。得菩提時。若有女人。為女百惡之所逼惱。極生厭離。願捨女身。聞我名已。一切皆得。轉女成男。具丈夫相。乃至證得無上菩提。
「轉女成男願」
經上常聞「轉女成男」，若干大眾據以攻擊「佛祖重男輕女」、「佛祖是大男人主義者」……。佛不執相，豈有男女分別心，有轉女成男的說法，確實是根據世間因緣的狀況來說的。
女性會有月事、懷孕等的生理狀況，加上心思較為細膩，相對易有對立、分別的心理煩惱。由是觀之，女性在修行路上確實比男性辛苦許多，這也是「轉女成男」的主要原因。
不容否認有些女性不以月事、懷孕為苦，心性正大開朗，此為「女中丈夫」，雖為女身，實則真丈夫！反之，有些男性縱情聲色，心多奸宄，雖得男身又有何用。
又如地藏王菩薩前身為婆羅門女、光目女，《法華經》記龍女八歲成佛，可知男女之別或有遇緣的差異，卻非成就的必然分野。
明白佛心就不會拘執男女之相，而能放下一切分別、執著，真心求上增進。
第九大願。願我來世。得菩提時。令諸有情。出魔羂網。解脫一切。外道纏縛。若墮種種惡見稠林。皆當引攝。置於正見。漸令修習。諸菩薩行。速證無上正等菩提。
「回邪歸正願」
魔與外道，迷惑人心，毀壞正法，令人痛惋。
佛是真慈悲，慈悲沒有敵人。以佛眼觀，魔與外道佛性不減，引入正見，回邪歸正，多一佛弟子，少一魔徒孫，這是真正的圓滿。
第十大願。願我來世。得菩提時。若諸有情。王法所加。縛錄鞭撻。繫閉牢獄。或當刑戮。及餘無量災難陵辱。悲愁煎逼。身心受苦。若聞我名。以我福德威神力故。皆得解脫一切憂苦。
「免難消災願」
信佛、學佛真能免除牢獄之災？
能，信佛、學佛必然深信因果。
未造業知畏因，必然斷一切惡，豈會輕蹈法網？已造業知受果，甘受諸報並造諸善，雖處悲愁煎逼，亦能坦然甘願。有些大眾造下惡業，以為只要相信特定宗教、門派就能免罪少罰，這是不當的僥倖心態，也錯解了信仰的真義，可謂愚頑至極，令人悲嘆。
第十一大願。願我來世。得菩提時。若諸有情。飢渴所惱。為求食故。造諸惡業。得聞我名。專念受持。我當先以上妙飲食。飽足其身。後以法味。畢竟安樂而建立之。
「飲食飽足願」
「先顧腹肚，才顧佛祖」這句話說得實際。多數人在衣食中打轉，忽悠過了一生，白白浪費人身修行的寶貴機會。藥師佛慈悲，為眾生發下飲食飽足願，協助眾生生活無虞，利益學佛修行。
食衣住行，為維持生活的基本。生活顧不好，求道修行將是更為艱險的長路；生活不匱乏，就有更多的心力精進提升，可知生活是修行得力與否的關鍵之一。
兼顧生活與修行是最佳的平衡點：不知道下一餐在哪裡，往往也看不到佛在哪裡？自己在哪裡？一味追求佳餚美食，慢慢增長貪心，日久必然一身染汙，恐將造下甚深罪業。
「甘心嚼菜根，知足就是福」－不讓飢寒成為修行的障礙，不讓貪欲蒙蔽本性的清淨，修行即生活，生活即修行，其中便有無窮智慧。
第十二大願。願我來世。得菩提時。若諸有情。貧無衣服。蚊蝱寒熱。晝夜逼惱。若聞我名。專念受持。如其所好。即得種種上妙衣服。亦得一切寶莊嚴具。華鬘塗香。鼓樂眾伎。隨心所翫。皆令滿足。
「妙衣莊嚴願」
修行路上有著許多風景，不能確定會遇上多少障礙，可以確定的是生活會愈來愈好。為什麼修行能讓生活變好？因為修福修慧得來的。
藥師佛發願滿足眾生衣食無缺、妙衣莊嚴、育樂具足，並非憑空虛言，而是教化眾生「種福得福，修慧得慧」，堅持修行必然有所受用，真正受用了就能堅定信心持續精進。
如何引領眾生修行？就是修出成果給眾生看。你修得神清氣爽，你修得無煩無惱，你修得自在愉快，誰看了都會願意跟的！
藥師佛告訴我們：好好修，一切皆令滿足。這給了我們很大的信心，等到真的有了成果，不只成就了自己，同時也成了別人學習的模範，這也是一種「自化化他」。
修行者應當曉得福是修來的，也該明白福會隨貪去，所以絕不會貪愛福報。受用福報的同時，他的希望是能與眾生分享，能給眾生作一個實例。
身在福中不貪福，知福惜福再造福－－此即藥師佛滿眾生願的真義。
藥師法門的殊勝可由十二大願深刻體現，十二大願的內蘊就是：身心如意。衣食無缺。回邪歸正。深信因果。持戒修行。利眾成佛。
只要老實修行，認真度眾，就能與藥師佛相應，得到不可思議的大成就。
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