1.通常一個細胞只會有一個到數個(few)鞭毛;一個細胞會有很多纖毛
2.鞭毛長度較長;纖毛長度較短
3.鞭毛活動能量的來源為:molecular engine，就是利用細胞膜內外的氫離子濃度差
產生的電壓為能量，此能量又稱為[proton motive force]。
纖毛活動能量來源為:ATP
兩者結構相同，內部的microtubules排列方式皆為9+2狀態。
鞭毛與纖毛的運動...
www.chem.uic.edu/fenteany/teaching/452/Motors.ppt
一般microtubules在ATP刺激後，其連接的dynein會運動，促使與dynein接觸的
microtubule向前滑動。
但是因為纖毛是包覆在細胞膜當中，且其9+2構造的基部又有固定的部份，使其無法整個microtubule向前滑動太多，因而只能彎曲。請參照第30.31張投影片鞭毛因基部構造關係，所使用的能量和纖毛有點不同。利用細胞膜內外的氫離子濃度的不同，細胞膜外氫離子濃度高，會有一個膜上的酵素將氫離子由膜外帶到膜內，此時會產生ATP，此ATP便促使鞭毛基部運轉，所以鞭毛是以旋轉的方式運動。請參照第37張投影片關於纖毛鞭毛是不是胞器?答案:是的。細胞中分為細胞液和胞器，所以鞭毛.纖毛是屬於胞器。線毛(pili):由許多菌毛蛋白(pilin)次單元團繞中心做螺旋狀排列，呈中空管狀。本身構造較鞭毛簡單，沒有basal body資料來源:http://66.102.7.104/search?q=cache:TlRMCx7kPuEJ:kejian.zzuli.edu.cn:8080/wsw/guide/2004jiaoan.htm+fimbriae+%E6%A7%8B%E9%80%A0&hl=zh-TW文章很長，可用"菌毛"搜尋文中將pili譯為性毛，其實國外用pili這個字也有指線毛(菌毛)的意思。另外，fimbriae = pili性毛:國外通常用---sex pili
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