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100年度營利事業所得稅結算申報案件查核作業將自本（101）年10月21日展開，為避免營利事業因不諳所得稅法規定或申報期忙碌疏忽，致未依規定報繳稅款，該局乃特別針對以往轄內營利事業常常發生之違章或疏失型態，籲請營利事業再行審慎檢視申報資料，是否有應注意而未注意事項，如在稽徵機關進行調查前，自動補報並補繳所漏稅款者，即可適用稅捐稽徵法第48條之1免罰規定，茲將常見之營利事業違章或疏失情形條列如附表：

類別	疏失情形
收入類	1、     短漏報保險理賠、海關退稅、銀行利息收入、補助款及領回未支付員工退休金或資遣費之退休金準備等。 2、     營利事業誤將應稅之國外證券交易所得列為停徵之證券交易所得。
費用及成本類	1、     呆帳損失未依財政部各地區國稅局審查營利事業呆帳損失認定原則之規定，取得合法之憑證。 2、     土地交易所得、證券交易所得、期貨交易所得、股利淨額或盈餘淨額等免稅或停止課徵所得稅或不計入所得額課稅之免稅所得，未依規定合理分攤相關成本、費用或損失。
股東可扣抵稅額帳戶及未分配盈餘	1、     經稽徵機關調查核定減少之應納營利事業所得稅，應於核定退稅通知書送達日，自股東可扣抵稅額帳戶中減除。 2、     營所稅經查獲短、漏報課稅所得額時，同年度ARE之 稅後純益，應一併申報。
租稅減免	一、申報抵減所得稅之設備或技術於交貨之次日起3年內轉借、出售或轉售。 二、研究發展支出未於營利事業所得稅結算申報時一併提出申請。
關係企業間交易	1、     關係企業間進銷貨受控交易之售價或成本顯著異常，或利潤留置海外，致交易未符合常規。 2、     關係企業之受控交易，選定不適宜之可比較對象，經稽徵機關重新選定可比較對象後，未附合常規交易範圍，而遭調整補稅。