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現役軍人薪餉及國民中小學、私立初級中、小學、幼稚園及托兒所教職員之薪資所得，自101年1月1日起恢復課稅，因此，國軍部隊、學校、幼稚園及托兒所自101年1月給付上開人員薪資所得時，扣繳義務人應依規定辦理扣繳。

屬100年12月31日以前應按月給付之薪資所得、或於100年12月31日以前有其事實，依規定應給付之休假、結婚、生育、眷屬喪葬及子女教育等補助費及兼、代課鐘點費，而於101年以後給付者，可適用修正前免納所得稅之規定。但100年度之年終獎金及考績獎金，應併入受領人取得年度綜合所得總額課徵所得稅。

【舉例說明】
國小教師甲君於101年9月1日除領取9月份薪資70,000元，另領取100年度之考績獎金70,000元，扣繳義務人於給付時，應依下列規定辦理：
一、9月份薪資70,000元，甲君無配偶及受撫養親屬，若選擇依薪資所得扣繳辦法規定扣繳，則按「薪資所得扣繳稅額表」扣取稅款2,060元，如選擇按全月薪資總額70,000元扣取5%，應扣取稅款3,500元。
二、100年度考績獎金70,000元屬非每月給付之薪資，因已超過101年度薪資所得扣繳稅額表無配偶及受扶養親屬者之起扣標準 68,501元，應按給付額扣取5%之稅款3,500元。